Le nom Ponta do Pargo provient d'une découverte faite par le capitaine Zarco et son équipage. En atteignant la pointe la plus à l'ouest de l'île, des marins leur ont apporté un grand poisson, semblable à un vivaneau, qui a donné son nom au lieu.
La paroisse de Ponta do Pargo existait déjà en 1518, avec son siège dans la chapelle de São Pedro. L'église principale a subi plusieurs reconstructions au fil des siècles, notamment à la fin du XVIIe siècle, dans les années 1850 et au milieu du XXe siècle. Une pierre armoriée aux insignes papales orne le portail latéral, en allusion à Saint-Pierre, le saint patron.
Plus récemment, le parvis de l'église a été modifié, avec le retrait du pavement traditionnel en calçada madeirense. Cette intervention, critiquée pour négligence dans la sauvegarde du patrimoine, a lieu malgré le soutien à la candidature de la "Calçada Madeirense" au Patrimoine Culturel Immatériel.