O nome Ponta do Pargo tem origem numa descoberta feita pelo capitão Zarco e sua tripulação. Ao chegarem à ponta mais a oeste da ilha, foram-lhes trazidos por marinheiros de Tristão e Álvaro Afonso um peixe de grande dimensão, semelhante a um pargo, que deu nome à localidade.
A paróquia da Ponta do Pargo já existia em 1518, com sede na capela de São Pedro. A igreja matriz sofreu várias reconstruções ao longo dos séculos, incluindo no final do século XVII, na década de 1850 e em meados do século XX. Uma pedra de armas com insígnias papais adorna o portal lateral, aludindo a São Pedro, padroeiro do templo. Uma inscrição na chave do arco, possivelmente de 1692, pode indicar uma campanha de reconstrução.
Recentemente, o adro da igreja foi alterado, com a remoção do tradicional pavimento em calçada madeirense. Esta intervenção, criticada por negligência na salvaguarda do património, ocorre apesar do apoio ao dossiê de candidatura da "Calçada Madeirense" a Património Cultural Imaterial.
