Wyspa Madera posiadała instytucję szkolnictwa wyższego na długo przed utworzeniem Uniwersytetu Madery w 1988 roku. Szkoła Medyczno-Chirurgiczna w Funchal została powołana dekretem 29 grudnia 1836 roku, aby zaradzić brakom lekarzy w regionie.
Zlokalizowana w Szpitalu Santa Isabel, w budynku, w którym dziś mieści się Pałac Rządu Regionalnego, szkoła rozpoczęła działalność w październiku 1837 roku. W pierwszym roku zapisało się 11 studentów, a pięciu ukończyło kurs w 1840 roku, stając się pierwszymi lekarzami kształconymi na miejscu. Początkowo kurs trwał trzy lata i wymagał jedynie podstawowej umiejętności czytania, pisania i liczenia.
Przez 73 lata swojej działalności instytucja wykształciła około 240 lekarzy, znacząco przyczyniając się do rozwoju edukacji i opieki medycznej w archipelagu. Szkoła Medyczno-Chirurgiczna w Funchal została zlikwidowana w listopadzie 1910 roku. Uroczysta sesja otwarcia szkoły odbyła się 15 października 1838 roku, co stanowiło ważny moment w historii ochrony zdrowia i edukacji na Maderze.